方块学园明川篇（即《明川灵闻录》）中介绍了大量的奇花异草或者偏僻的植物[1]，由于都属于无生命的，且出现次数过少，单独列出没有太大实际价值，此处一并列出。
资料尽量引用《山海经》，如果没有特别标注为其他古籍，一般都为《山海经》所记载。其中可能会有部分未翻译或无法翻译的文言文。
如果古文与现代文出现歧义，则在后面用括号备注。
迷榖（ ）[2]
出自第二集【大荒集市】
《山海经·南山经》
原文：南山经之首曰䧿山。其首曰招摇之山，临于西海之上。…………有木焉，其状如榖而黑理，其花四照。其名曰迷榖，佩之不迷。
翻译：南方首列山系叫做鹊山山系。鹊山山系的头一座山是招摇山，屹立在西海岸边。…………山中有一种树木，形状像构树却呈现黑色的纹理，并且光华照耀四方，名称是迷榖，人佩带它在身上就不会迷失方向。
药（ ） [4]
出自第六集【感冒】
《康熙字典》[5]
《唐韵》以灼切《韵会》弋约切，音
现代注释：芍药（一说为白芷）
虈（ ）[4]
出自第六集【感冒】
现代注释：白芷
芎（ ）䓖（ ）[4]
出自第六集【感冒】
现代注释：治疗头痛之首选药物。月经不调；经闭痛经；产后瘀滞腥痛；症瘕肿块；胸胁疼痛；头痛眩晕；风寒湿痹；跌打损伤；痈疽疮疡
扶桑
出自第十二集【扶桑若木】
《山海经·海外东经》
原文：汤谷上有扶桑，十日所浴。
翻译：下面有汤谷。汤谷边上有一棵扶桑树，是十个太阳洗澡的地方。
若木
出自第十二集【扶桑若木】
《山海经·海内经》
原文：南海之外，黑水青水之间，有木名曰若木，若水出焉。
翻译：在南海以内，黑水青水流经的地方，有一种树木名叫若木，而若水就从若木生长的地底下发源。